En el año 1990, el Estatuto General de la UAEH se modifica y crea la “División de Docencia”, la que se constituye como órgano asesor técnico–pedagógico, que tiene como objetivo general coadyuvar con las escuelas de Bachillerato y Superior, la coordinación de acciones docentes que permitan asegurar y elevar la calidad y la pertinencia del proceso de enseñanza-aprendizaje en sus niveles medio superior, medio superior terminal y licenciatura. Este objetivo quedó refrendado en la reforma del Estatuto General de fecha 22 de marzo de 2013. Con la reestructuración organizacional que dio cumplimiento al Programa de Desarrollo Institucional (PDI 2018-2023), la División de Docencia cambia de denominación a División Académica, a partir del Estatuto General aprobado el 20 de marzo de 2017, por lo que incrementan el número de direcciones que la conforman, entre ellas, emerge la Dirección de Estudios de Pertinencia, Factibilidad y Viabilidad.
Se trata de una historia joven que inicia en el año 2018, con la gestión rectoral del Mtro. Adolfo Pontigo Loyola. Anterior a este año, la responsabilidad de coordinar la elaboración del estudio de pertinencia recaía en la Dirección de Educación Superior.